Boca irá frente al ganador de Nacional de Paraguay o Alianza Lima de Perú en la segunda fase del repechaje para entrar a la fase de grupos de la Copa Libertadores producto de haber clasificado como el tercero de la tabla anual de la Primera División del fútbol argentino.

En el sorteo que se realizó en Luque, Paraguay, el "Xeneize" ocupó el bombo uno gracias al ranking Conmebol por lo que esquivo posibles fuertes rivales, y en caso de pasar, enfrentará al ganador de Independiente de Santa Fe o Deportes Iquique.

La edición 2025 podría significar el retorno de Boca a la fase de grupos de la Copa Libertadores, luego de ausentarse en el 2024 por jugar la Copa Sudamericana. En el caso de que el conjunto de la Ribera no llegue a la fase de grupos, para clasificar a la Sudamericana deberá al menos, perder en Fase 3.

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